傈僳族在20世纪50年代仍保存着相当浓厚的万物有灵自然崇拜的原始信仰，至今多神原始信仰在民间还大量存在。傈僳族原始信仰认为，天、地、山、水、岩石、树木、风、雨、雷、电都有特定的“尼”，疾病灾害与“尼”有关，生产、生活与人生都要受“尼”庇佑。“尼”即是“鬼”或“精灵”的意思，尼的种类繁多，主要信仰的鬼灵有“白加尼”（天鬼）、“海夸尼”（家鬼）、“朱司尼”（山鬼）等，因为“尼”有无比的力量，所以必须杀牲祭祀。尼扒、尼古扒即巫师的两个等级称谓，二者是鬼神之间的沟通者，巫师能卜卦凶吉。

除了鬼神外，傈僳族还有祖先崇拜，他们认为人死后灵魂不死，祖先肉体虽已死去，但灵魂仍然保佑着本氏族的后人。每一氏族都有自己崇拜的祖先，每年一定的时候都要举行仪式来祭祖，求祖先庇佑后人平安。随着50年来社会变革的影响和现代科学技术及现代教育的普及，原始信仰的人群发生了变化，年轻一代中“鬼神”观念已渐淡薄，或完全不信，老年人群中原始信仰的较多。

部分傈僳族还信仰基督教。随着外国列强对中国的侵略，西方的基督教于1913年传入怒江。基督教传入后，在怒江盖教堂，发展信徒。为了传教，外国传教士与傈僳族教徒合作，创制了拉丁化的傈僳文，翻译了傈僳文《圣经》。1949年以后，经过宗教革新，教会组织开展了自传、自养、自治的"三自"爱国教育，现在傈僳族信徒都能站在爱国主义立场上进行自由正常的宗教活动。